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dendrites
管 理 员
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我不鼓励捐款攀比，捐的少的不一定小气，但捐的多的一定是为国为民！台湾同胞与我们骨肉相连！
彻底明白支持国产的意义 5月15日更新
转贴： （不完全摘录）
捐款的企业明细----> 国美电器700万，交通银行1200万，苏宁电器500万，招商银行
800万，新希望500万，中国平安500万，中国人寿1600万，泛海建设1000万，中国建行
2000万，中国工行1200万，中国银行1000万，民生银行1000万，南方航空1000万，中国
石化1000万，中远集团1000万，三一重工1800万，长虹652万，海信集团600万，浦发银
行500万，哈药集团500万，伊利集团100万，宇通客车100万，仁和集团300万，TCL集团
100万，长江证券100万，中石油1000万及成品油10万吨，江淮汽车200辆车，华北制药
100万，格力电器800万，雅戈尔 500万，新湖创业 1000万，上海汽车1000万，北汽集
团1000万，山西汾酒50万，海信600万，青岛啤酒100万，绵世股份50万，*st中绒50万
......
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dendrites @ 2008-05-16 01:57 评论(0) |
| 2008-4-10 星期四(Thursday) 晴 |
http://laiba.tianya.cn:80/laiba/AlbumListL?uid=8938246046474121508
同志们，朋友们，到我的相册里面来看奥运圣火传递！
火炬传万里，中华当自强！......
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dendrites @ 2008-04-10 14:07 评论(0) |
| 2008-4-9 星期三(Wednesday) 晴 |
5. 后记
故事说完了，回味一把，兼回答ongoing的问题“你上面说植入晶状体视力恢复正常，怎么RGC的轴突还是没走对？没走对怎么可以有视觉？”
这个问题提的很好，问到了本篇故事的核心，也是最有意思的地方。
当时cori bargmann问那个问题的时候，我就眼前一亮。当时看到的表形是突变鱼丧失了视觉，视网膜神经节细胞轴突错位，但被突变的分子并不在神经系统中，在视顶盖的表面，和眼睛的晶状体里。在这个时候，如何用最简单的实验来说明最重要的问题，问题是，为什么鱼看不见了，是不是仅仅因为丧失了晶状体的缘故？
如果不是，那说明视网膜神经节细胞的轴突错位还是对视觉有些贡献，如果是，就说明视网膜神经节细胞的轴突错位不影响鱼的视力，至少对于他们检测的任务来说。
（说到这，我特意去查了查作者2005年在Development上发表的文章，里面讲解了他们怎么设计这个遗传突变筛选的，里面用到的视觉功能指标果然是非常简单的能否区分亮暗。）
好了，所以将好的晶状体移植到突变鱼中，就能立马解决这个疑问。这不是多难的问题，谁都想的到，但......
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dendrites @ 2008-02-09 06:12 评论(0) |
4. 收网
得，白高兴了半天，这拉网分子根本就不在神经系统中，那么这视网膜神经节细胞的轴突究竟是怎么错位的呢？
好不容易筛到的东东，也不能说扔就扔阿，做science最痛苦的就在这里，一个看上去非常简单的东西，其实机理可能非常复杂，本着面对困难绝不后退的硬骨头6连精神，也是为了为了把这个故事说圆，本篇文章作者又辛苦的做了一年。
作者在文章Figure.5中确认，神经细胞里把这个拉网分子突变，定位确实不受影响，这叫RGC non-autonomous。这个概念非常重要，因为当我们做某一个基因突变时，看到表形，要问的第一个问题就是，究竟是不是cell autonomous的。比如说，如果发现的是一个视网膜神经节细胞中的分子突变导致了定位失败，那么就是cell autonomous的，怎么确证呢？你仅仅讲视网膜神经节细胞中的分子突变，而不动其他组织细胞中的基因，看到了表形，就是视网膜神经节细胞的异常引起的。因为在基因突变鱼中，这个基因整个就被破坏了，所以什么组织里都没有这个基因，你无法知道，是因为神经系统里面缺失了这个基因......
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dendrites @ 2008-02-08 06:33 评论(0) |
3. 撒网
筛选开始了，一个看不见东西的鱼引起了他们的注意。拿出来一看，嘿，这神经元送到顶盖的轴突还真受影响了！见原文章 Figure.1，2，3。而且还是特别有意思的影响，表现位轴突迷路了，本来该老老实实进指定层的轴突胡乱就位。perfect phenotype!
接下来他们就找究竟是什么基因被破坏了，基因找到，命名为 dragnet，拉网，很形象阿，神经元伸出的轴突就像渔网一样的，这个基因看来是管撒网拉网的。但是这个基因被找到后，居然是一个胶原蛋白？！
Baier在2006 GRC给talk的时候说，如果是IgG superfamily, great, 其他的细胞粘连分子，good, but 胶原蛋白？@#@#$#$%^$%^%^&%^&！
因为什么呢？现在被发现的一些具备导向功能的分子大多有一些特征，比如说IgG domain阿什么的，这胶原蛋白，从来没听说有这种导向功能。先不管，如果真可以干这个，不也是一个大突破嘛？
接下来他们看看这个基因究竟在那里表达吧，怪事出现了，这个拉网分子居然不在神经系统里面表达，而是在......
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dendrites @ 2008-02-07 02:52 评论(0) |
| 2008-2-6 星期三(Wednesday) 晴 |
2. 传说
话说这篇文章的起源是企图研究这个问题，神经细胞轴突的分层分布究竟是如何形成的。
这个问题现在比较热。首先，我们知道神经系统许多部分都是分层分布的，比如大脑皮层，分5-6层，每层的细胞分布都有不同，功能也不同，大脑皮层的大门是第4层。那么比如说大脑皮层的神经细胞输入，大多是丘脑传过来的，丘脑的神经元轴突，究竟是怎么知道把轴突送到大脑皮层第4层去呢？万一送错了不就麻烦了嘛？
这个问题现在为什么热呢？说到底这是一个神经细胞轴突导向在体内是如何调控的问题。神经细胞轴突导向已经热了有些年，marc tessier-levigne and et al.把神经细胞在脊髓发育中的过程研究的非常透彻，克隆了一系列终于的分子，比如说netrin, 已经goodman克隆的 semaphorin.这些分子都被证明对神经细胞轴突导向的过程中非常重要。
但是以前所有的实验要么是果蝇，要么是脊髓系统，还没有人能非常清楚的研究，在最重要的体内系统－－大脑中，神经元的轴突导向是如何调控的。比如我说的这个大脑皮层的输入究竟是如何维持如此专一的特异性的。......
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dendrites @ 2008-02-06 03:11 评论(0) |
| 2008-2-6 星期三(Wednesday) 晴 |
1. 背景阅读
Nature Neuroscience 10, 1529 - 1537 (2007)
Published online: 4 November 2007 | doi:10.1038/nn2002
Lamina-specific axonal projections in the zebrafish tectum require the type
IV collagen Dragnet
Tong Xiao & Herwig Baier
这篇要写的是主要是这篇文章，寻找分层导向分子的故事。
这篇文章的主角叫 dragnet, 拉网，于是称为拉网小调。
第一次听到这个故事是2006年8月份的GRC，Baier第一次讲这个研究，当时听的非常有意思，但是文章还没发表出来，所以不好
多说。现在文章终于出来了。于是可以讲一讲我所知的文章背后的故事。......
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dendrites @ 2008-02-06 03:10 评论(0) |
Figure 4. 尾声。
接下来，我不说大家也应该知道他们做了什么了。
他们对p25过表达AD模型老鼠的大脑中注射HDAC抑制剂，获得了和丰富环境非常类似的疗效。条件反射学习增强，空间学习增强。而且对已经学习而获得的记忆回忆能力也增强。
数据基本就是把figure1,2再重复了一遍。
还有点值得讨论的是，HDAC抑制剂对回忆机制的影响。
Tonegawa2002年一篇science article在海马CA3中敲除NMDA受体，结果发现小鼠的回忆受影响了，那个结果很make sense，因为海马中的神经网络对于对以往记忆的抽取应该是有贡献的。
那么HDAC抑制剂的结果说明了什么？很有意思，说明了对以往记忆的抽取可能也是依赖于转录的，至少增强转录也能促进回忆。这个东西以前别人没有那么详细做过。
因为大家都觉得，新学习的时候，看阿，学阿，神经活性诱导基因表达，然后我们就学会了。
而回忆是否与转录机制有关非常不清楚，也不是很make sense，因为回忆无非是把一些储存在......
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dendrites @ 2007-05-27 06:06 评论(1) |
Figure3, 正题。
从Figure 2，我们知道，作者给予p25过表达模型丰富环境的刺激，成功的提高了AD模型模型小鼠的高级认知能力。不仅仅表现为增强学习能力，还表现为对已经形成的记忆大大增强了回忆的能力。实在很有意思。那么分子机制究竟如何呢？
我们可以想象，在老鼠在游乐场happy的时候，大脑中必定经过的非常复杂的变化，很多基因被打开或关上，而对已经被损伤的神经网络产生了修复的作用。这篇文章的作者选择了一个方向继续讨论，就是我前面背景说的epigenetics调控方面。
她们发现在野生型老鼠在游乐场玩乐的时候，海马区和大脑皮层中的组蛋白乙酰化水平有部分上调。
这个结果前面有人argue，并不具备说服力，说的非常对。
第一，needlescrub指出，她们并不能说明甚至是神经元中发生的变化，exactly!那么怎样说明确实是神经元中发生的变化呢？可以用她们做突触蛋白IHC的方法，直接看神经元中的免疫组化鉴定出的信号强度。问题是，可惜，我从来不相信IHC给出的蛋白水平上调或下调有说服力，因为很简单，做免疫......
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dendrites @ 2007-05-27 06:05 评论(0) |
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